A educação em São Francisco de Goiás tem avançado em todos os aspectos, especialmente na alfabetização. E o resultado veio através do Selo Nacional de Alfabetização onde o município tirou nota máxima e recebeu selo ouro. A avaliação foi realizada pelo Governo Federal, onde levou em consideração o Programa Alfa Mais Goiás.
Através do AlfaMais Goiás os estudantes franciscanos tem adquirido mais conhecimento e melhorado a aprendizagem com o apoio das profissionais de educação. O programa disponibiliza kit de material escolar e livros didáticos (LEIA) aos estudantes, e cursos de capacitação aos professores.
Ao longo de todo o ano letivo as professoras participam de capacitações que o programa oferece. E na última segunda-feira (25) aconteceu mais um curso para a equipe pedagógica da Creche Beato Arnaldo Janssen e da Escola Municipal Padre Humberto Dunkel, visando focar na valorização do estudante e professor.